Кроме генерации .com файла напрямую можно делать исполняемый DOS-файл поэтапно.
Рассмотрим исходный код:
<code=asm>use16
bits 16
section .text
..start: mov	ax,0x4c00
	int	0x21
</code>
Он не выполняет ничего полезного, но будет служить нам каркасом.

Компиляция:
<code=bash>nasm test.s -o test.obj -f as86</code>
Линковка:
<code=bash>ld86 test.obj -o test.exe</code>